C0474 - BÚSQUEDA DE GENES MUTADOS EN MENINGIOMAS CON Y SIN RECIDIVA MEDIANTE SECUENCIACIÓN DEL EXOMA COMPLETO
1Servicio de Bioinformática, Universidad de Salamanca, Nucleus, Salamanca, España. 2Complejo Asistencial Universitario de Salamanca, Salamanca, España. 3Hospital Clínico de Salamanca, Salamanca, España. 4Universidad de Salamanca, Salamanca, España.
Objetivos: Nos propusimos identificar en pacientes con meningioma intervenidos al diagnóstico o en la recidiva, mutaciones en los genes más frecuentemente asociados a meningioma (AKT1, ARID1B, BAP1, BRAF, CDKN2A, CDKN2C, GNA11, GNAQ, KLF4, NF2, NRAS, PIK3CA, PTEN, SF3B1, SMARCA4, SMARCB1, SMO, TERT, TP53, TRAF7) para establecer su incidencia y tipo de mutaciones.
Métodos: Se analizaron 35 muestras de meningiomas (23 en el momento del diagnóstico y 12 en la recidiva, dos recidivas pertenecen al mismo paciente) mediante secuenciación de exoma completo (WES). El ADN se obtuvo mediante métodos convencionales y se realizó la captura del exoma para su posterior secuenciación. Del total de 25.939 genes secuenciados, tras análisis bioinformático, se seleccionaron los genes de interés y se anotaron las variantes encontradas en los mismos.
Resultados: Se encontraron 47 mutaciones localizadas en 12 de los 20 genes candidatos. Las mutaciones detectadas por paciente oscilaron entre 0-3 variantes. Los genes con mayor número de mutaciones fueron: NF2 (16 tumores: 46%), SMO (11 tumores: 31%) y PIK3CA (6 tumores: 17%). Las mutaciones existen tanto en meningiomas al diagnóstico como en la recidiva (NF2: 52% frente a 33%; SMO: 31%frente a 8% y PIK3CA: 22% frente a 8%), siendo significativa la diferencia para SMO (p = 0,05). Se identificó la posición genética, los nucleótidos afectados y los SNP correspondientes (rs79014342, rs2230461, rs145785954, rs139125255, rs41304185, rs111694017, rs121918347, rs200106152, rs150375845, rs121434592, rs1042522, rs186823009 y rs121434259). En los meningiomas con recidiva no se encontraron mutaciones en los genes AKT, PTEN y SF3B1 y estaban mutados BAP, GNAQ y KLF4.
Conclusiones: Nuestros resultados revelan que los genes que presentan mayor número de mutaciones son: NF2, SMO y PIK3CA, siendo las mutaciones en SMO significativas en meningiomas no recurrentes. Además, identificamos 3 genes que podrían ser específicos y tener valor pronóstico en meningiomas recurrentes: BAP1, GNAQ y KLF4.
Proyecto_IBY 16/00002.
